জামায়াতের ভারপ্রাপ্ত আমির হিসাবে সাবেক সংসদ সদস্য অধাপক মুজিবুর রহমান ও সেক্রেটারি জেনারেল হিসাবে দায়িত্ব পেয়েছেন মাওলানা এটিএম মাসুম। জামায়াতে ইসলামীর আমির মকবুল আহমাদ এবং সেক্রেটারি জেনারেল ডা. শফিকুর রহমানকে গত ৯ই অক্টোবর রাতে গ্রেপ্তারের পরিপ্রেক্ষিতে দলটির গঠনতন্ত্র মোতাবেক এ দায়িত্ব দেয়া হয় বলে আজ মঙ্গলবার সংগঠনটির এক প্রেস বিজ্ঞপ্তিতে এ তথ্য জানা গেছে।